L'ADN humain est inévitablement présent dans les analyses métagénomiques des microbiotes humains. Bien que les protocoles actuels éliminent l'ADN humain avant soumission aux dépôts publics, l'ADN mitochondrial (ADNmt) a été négligé et persiste fréquemment. Nous discutons des risques de confidentialité et des opportunités de recherche associées à l'ADNmt, exhortant la communauté scientifique, éthique et juridique à prendre en compte.