Environ 600 employés du CDC dans des départements clés ont été licenciés suite aux actions de l'administration Trump. Ces licenciements ont ciblé les bureaux responsables des statistiques de santé, de la prévention des blessures, des relations avec le Congrès et des ressources humaines. Bien que certains avis de licenciement aient été annulés, les suppressions restantes pourraient nuire aux efforts de santé publique, affectant le fonctionnement quotidien de l'agence. Les licenciements touchent également des programmes tels que la National Health and Nutrition Examination Survey et un bureau d'éthique. Les syndicats d'employés contestent les licenciements devant les tribunaux, alléguant un abus de pouvoir illégal. Les critiques craignent que ces suppressions, associées à des réductions antérieures et à des événements récents, n'affaiblissent la capacité du CDC à protéger le public. Certains responsables ont également invoqué une "erreur de codage" comme raison des licenciements massifs. Le Epidemic Intelligence Service et le Morbidity and Mortality Weekly Report ont vu les suppressions initiales annulées. D'anciens responsables du CDC expriment leur inquiétude quant aux conséquences à long terme pour la santé publique. Les syndicats demandent à un tribunal fédéral d'invalider les licenciements.