La fonction de messagerie directe de Threads est actuellement disponible aux utilisateurs âgés de 18 ans et plus sur Android, iOS et le web. Initialement, elle ne prend en charge que les conversations en un-à-un. Les mises à jour futures permettront aux utilisateurs de contrôler qui peut leur envoyer des messages, y compris les non-abonnés. Un dossier de demande de message, similaire à X, est également prévu. Threads développe la messagerie de groupe et les filtres de boîte de réception. Malgré les allégations de confidentialité robuste, Threads ne prendra pas en charge le cryptage de bout en bout pour sa messagerie. Un porte-parole a confirmé ce manque de cryptage de bout en bout, déclarant que Meta s'adaptera en fonction des commentaires des utilisateurs. L'auteur critique cette décision, la jugeant inacceptable pour une nouvelle plateforme de messagerie. Il a partagé un anecdote sur l'utilisation des DM de Threads pour échanger des informations de contact pour passer à iMessage. L'auteur a également rencontré des difficultés pour accéder aux DM sur l'application web de Threads, malgré les rapports sur sa disponibilité. Cela suggère un test A/B potentiel ou des déploiements précoces affectant l'expérience utilisateur.