Un mécanisme de fragmentation basé sur chaperonne-protéasome est essentiel pour l'aggréphagie
Mauthe et al. ont constaté que la clairance des agrégats protéiques nécessite la fragmentation de l'agrégat par un module chaperon et une particule régulatrice du protéasome pour le recrutement et le regroupement des récepteurs de l'autophagie sélective afin d'initier la formation du phagophore.