シングルセルRNAシーケンシング（scRNA-seq）は、個々の細胞における遺伝子発現を測定する方法であり、数百万の細胞全体で平均化するのではなく、各ユニークな細胞について、細胞分化、細胞周期、刺激応答を含む様々な細胞プロセスを観察することを可能にします。これは、生物学的プロセスの高解像度のスナップショットを提供します。しかし、同じ細胞を継続的に時間追跡するわけではありません。この限界に対処するために、擬似時間として知られる推測された発生軌道に沿って細胞のスナップショットを計算論的に配置する、軌道推論アプローチが開発されています。