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CSIRO、AWSでサーバーレスアーキテクチャを活用し、ゲノム変異を100倍クエリ
CSIROは、VCFファイルを中央データベースにコピーすることなくゲノム変異をクエリするためのサーバーレスアーキテクチャであるServerless Beaconを開発しました。このシステムは、Amazon S3、Lambda、Athena、DynamoDBを組み合わせ、メタデータインデックスとHTTPバイト範囲リクエストを使用して圧縮されたゲノム領域をクエリします。テストでは、10,000塩基対のクエリで平均1.52秒のレイテンシが報告されました。Leela Kumiliによる