二本鎖DNA脱アミナーゼを用いた、クロマチンアクセシビリティ... ノート

二本鎖DNA脱アミナーゼを用いた、クロマチンアクセシビリティとCRISPR編集の同時プロファイリング

Targeted deaminase-accessible chromatin sequencing (TDAC-seq) は、二本鎖DNAシトシンデアミナーゼを用いて、標的遺伝子座における長いクロマチンファイバー全体のクロマチンアクセシビリティを測定する手法です。TDAC-seqをプールされたCRISPR変異スクリーニングと組み合わせることで、CRISPRによる撹乱後のクロマチンアクセシビリティの変化を高スループットで検出することが可能になり、内在性のシス調節エレメント内における配列と機能の関係を詳細にマッピングすることができます。