系統解析の基礎を学ぶ ノート
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系統解析の基礎を学ぶ

🧬🔬 ゲノムから系統樹までの系統解析を探求! R/Bioconductor を用いた基本的なワークフロー。大規模なゲノムデータセットの扱い方を学びました。データセットの脱水、抽出に barrnap、ツリー構築に rapidNJ、可視化に FigTree を使用して、10,000 以上の大腸菌株から 16S rRNA を抽出しました。動機:その後、 Bioconductor に関する前回のハンズオン経験の後、私たちは...