真核生物の祖先的な遺伝子レパートリーの再構築は、多様な微生物との一連の密接かつ長期的な相互作用の痕跡、および遺伝子交換におけるウイルスの役割を明らかにしている。この発見は、真核生物が単に2つの生物の単純な合併から進化したという見方に異議を唱えるものである。