オートファジーおよびエンドソーム輸送におけるその役割で以前から認識されているホスファチジルイノシトール3-キナーゼクラスIII（PI3K-3）は、現在、核内でも機能することが示されている。最近の研究では、PI3K-3が転写機構およびクロマチン修飾複合体と関連し、絶食中の転写適応に寄与することが示されている。