ネオアンチゲンを発現する腫瘍細胞と腫瘍特異的T細胞との間の細胞ごとの相互作用は、ほとんど未解明のままでした。シングルセル空間トランスクリプトミクスフレームワークは、ネオアンチゲンを発現する腫瘍細胞と腫瘍浸潤T細胞のマッピング、およびT細胞受容体シーケンシングを可能にします。このアプローチは、腫瘍微小環境における明確な免疫ニッチとその腫瘍特異的応答を決定する特性を明らかにします。