spIsoNetは、単粒子クライオ電子顕微鏡（cryo-EM）における好ましい方向問題（preferred-orientation problem）によって引き起こされる再構築とミスアライメントの課題に対処するための、自己教師ありの深層学習ベースのエンドツーエンドソフトウェアです。spIsoNetは、クライオ電子トモグラフィー（cryogenic electron tomography）における好ましい方向を持つ分子のサブトモグラム平均化（subtomogram averaging）中に、地図の等方性（map isotropy）と粒子のアライメントを改善することもできます。