Секвенирование РНК единичных клеток (scRNA-seq) — это метод измерения экспрессии генов в отдельных клетках, позволяющий наблюдать различные клеточные процессы, включая дифференцировку клеток, клеточный цикл и реакцию на стимулы, для каждой уникальной клетки вместо усреднения по миллионам клеток. Он предоставляет снимки биологических процессов с высоким разрешением. Однако он не отслеживает одну и ту же клетку непрерывно во времени. Для устранения этого ограничения были разработаны подходы к выводу траекторий, которые вычислительно упорядочивают клеточные снимки вдоль предполагаемой траектории развития, известной как псевдовремя.