Мы разработали базовую модель для организации 3D-генома из структуры хроматина, полученной из данных Hi-C. HiCFoundation поддерживает интегративный анализ, связывающий архитектуру генома с функцией регуляции вниз по потоку. Благодаря крупномасштабной самообучению с предварительной подготовкой на данных Hi-C, за которой следует тонкая настройка на задачи вниз по потоку, она обеспечивает унифицированную, эффективную, обобщаемую и интерпретируемую парадигму для анализа 3D-генома, отдельных клеток и мультиомики во всех видах.