Некоторые растения, включая бобовые, образуют специализированные корневые органы, известные как клубеньки. Эти растения устанавливают симбиотические отношения с азотфиксирующими бактериями и используют атмосферный азот. Этот процесс, называемый "симбиозом корневых клубеньков", является важной биологической функцией, которая может снизить зависимость от химических азотных удобрений. На генетическом уровне предыдущие исследования, в основном на бобовых, показали, что транскрипционный фактор nodule inception (NIN) необходим для симбиоза корневых клубеньков. Этот вывод привел к преобладающему мнению, что потеря гена NIN является основной причиной потери клубенькообразования.