ДНК человека неизбежно присутствует в метагеномных анализах микробиомов человека. Хотя текущие протоколы удаляют ДНК человека перед подачей в публичные репозитории, митохондриальная ДНК (мтДНК) была упущена и сохраняется чаще. Мы обсуждаем риски конфиденциальности и возможности исследований, связанные с мтДНК, призывая к рассмотрению со стороны научной, этической и юридической общин.