При объединении данных секвенирования РНК длинных прочтений из нескольких образцов транскрипты могут быть идентифицированы до или после слияния. Данное исследование показывает, что ни один из подходов не является универсально оптимальным, и предоставляет рекомендации, основанные на используемом программном обеспечении и целях исследования.