Реконструкция генофонда предковых эукариотических клеток выявляет следы ряда тесных, долгосрочных взаимодействий с разнообразными микроорганизмами и роль вирусов в обмене генами. Эти открытия ставят под сомнение представление о том, что эукариотические клетки произошли от простого слияния всего двух организмов.