Samtools v1.22.1 Unsachgemäße ... Notiz

Samtools v1.22.1 Unsachgemäße Behandlung übermäßiger Histogramm-Bin-Anzahl in Samtools Coverage führt zu Stack Overflow

Gepostet von Ron E am 30. September Im samtools coverage Unterbefehl ermöglicht die Option -w / --n-bins dem Benutzer, anzugeben, wie viele „Bins“ im Coverage-Histogramm erzeugt werden sollen. Der Code berechnet: stats[tid].bin_width = (stats[tid].end - stats[tid].beg) / n_bins; Wenn die Anzahl der Bins (n_bins) im Verhältnis zur Regionlänge (end - beg) extrem groß ist, kann diese Ganzzahldivision Null ergeben oder zu unerwartetem Verhalten bei nachfolgenden Berechnungen führen. Später in print_hist(),...