Мы представляем CellNavi, фреймворк глубокого обучения, который предсказывает ключевые гены, управляющие клеточными переходами, моделируя состояния клеток на биологически значимом многообразии. Мы продемонстрировали, как предсказания ключевых генов с помощью CellNavi имеют потенциальные применения в развитии клеточной терапии, выявлении ключевых факторов, вызывающих клеточные заболевания, и идентификации критически важных генов, участвующих в реакции на лекарства.