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Entschlüsselung der epigenomischen Sprache einzelner Zellen mit einem Fundamentmodell
EpiAgent, ein auf Transformatoren basierendes Foundation-Modell, das auf etwa 5 Millionen Zellen und über 35 Milliarden Tokens vortrainiert wurde, hat die Einzelzell-Epigenomik durch die Kodierung der Chromatinzugänglichkeit als „Zellensätze“ vorangetrieben. Von diesem Framework profitierend, erreichte EpiAgent Spitzenleistungen bei typischen nachgelagerten Aufgaben und ermöglichte die Vorhersage von Perturbationsantworten sowie In-silico-Knockouts von Chromatinregionen.