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Gemeinsame Profilerstellung der Chromatinzugänglichkeit und CRISPR-Edits über doppelsträngige DNA-Deaminasen
Targeted Deaminase-Accessible Chromatin Sequencing (TDAC-seq) misst die Chromatinzugänglichkeit über lange Chromatinfasern an gezielten Loci unter Verwendung von doppelsträngigen DNA-Cytidindeaminasen. In Kombination mit gepooltem CRISPR-Mutations-Screening ermöglicht TDAC-seq den Hochdurchsatznachweis von Veränderungen der Chromatinzugänglichkeit nach CRISPR-Störungen und erlaubt die Feinzuordnung von Sequenz-Funktions-Beziehungen innerhalb endogener cis-regulatorischer Elemente.