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Reproduzierbare Annotation von T-Zell-Untergruppen und Aktivierungszuständen mit Genexpressionsprogrammen
Wir haben T-CellAnnoTator (TCAT) entwickelt, eine computergestützte Methode, die bei der Identifizierung von T-Zell-Subpopulationen, Aktivierungszuständen und Funktionen hilft. Dies geschieht anhand reproduzierbarer Genexpressionsprogramme, die in vielen Krankheitskontexten und Geweben gefunden wurden. TCAT übertrifft herkömmliche Ansätze zur Vorhersage von T-Zell-Subpopulationen, ist einfach programmatisch oder über eine Website zu verwenden und kann für andere Zelltypen angepasst werden.