RSS Nature Cell Biology

Выявление пространственных метагенов высокого разрешения из пространственной транскриптомики

Мы представляем SpaHDmap, фреймворк глубокого обучения, который объединяет гистологические изображения с данными пространственной транскриптомики для получения пространственных метагенов высокого разрешения и интерпретируемых. Мы демонстрируем, что SpaHDmap эффективно генерирует мелкозернистые пространственные метагены, выявляет уточненные пространственные структуры и позволяет проводить совместный анализ нескольких образцов в различных экспериментальных условиях.
favicon
nature.com
Revealing high-resolution spatial metagenes from spatial transcriptomics