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CSIRO 采用无服务器架构,在 AWS 上查询数量提升 100 倍的基因组变异

CSIRO 开发了 Serverless Beacon,这是一种无需将 VCF 文件复制到中央数据库即可查询基因组变体的无服务器架构。该系统结合了 Amazon S3、Lambda、Athena 和 DynamoDB,利用元数据索引和 HTTP 字节范围请求来查询压缩的基因组区域。测试结果显示,对于 10,000 个碱基对的查询,平均延迟为 1.52 秒。作者:Leela Kumili
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