单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）是一种用于测量单个细胞中基因表达的方法，使得能够观察各种细胞过程，包括细胞分化、细胞周期和刺激响应，针对每个独特的细胞而非在数百万个细胞之间取平均值。它提供了生物过程的高分辨率快照。然而，它无法在时间上连续追踪同一个细胞。为了解决这一局限性，已开发出轨迹推断方法，这些方法在计算上将细胞快照沿推断出的发育轨迹进行排列，该轨迹被称为拟时间（pseudotime）。