AWS HealthOmics 为 Nextflow 工作流引入了资源回退顺序”
今天,AWS HealthOmics 为 Nextflow 工作流中的任务引入了资源回退指令,使您能够定义首选加速器类型的有序列表,并包含回退至 CPU 实例的选项。研究人员和生物信息学家可以利用此指令,减少因加速器限制而进行诊断和重新提交运行所花费的时间,从而保持生产工作流的持续运行。AWS HealthOmics 是一项符合 HIPAA 要求的服务,可帮助医疗和生命科学客户通过完全托管的生物信息学工作流,大规模加速科学突破。针对 Nextflow 工作流的资源回退功能,您可以为任务指定首选加速器。当首选加速器不可用时,HealthOmics 会在无需重新提交的情况下,自动按照您指定的回退顺序遍历替代选项。每个加速器配置文件均设有可配置的超时时间,使您能够控制 HealthOmics 在转向下一个选项之前搜索该加速器的时长。较短的超时时间有助于快速遍历回退顺序,而较长的超时时间则提高了预留首选加速器的概率。此外,您还可以将 CPU 配置文件作为最终回退选项,以增加任务成功预留实例的可能性。现在,您可以在所有 AWS HealthOmics 区域中使用针对 Nextflow 工作流的资源回退功能:美国东部(北弗吉尼亚、俄亥俄)、美国西部(俄勒冈)、欧洲(法兰克福、爱尔兰、伦敦)、以色列(特拉维夫)以及亚太(首尔、新加坡、东京)。欲了解更多信息,请访问高级资源配置和 Nextflow 特定文档。