据报道，林肯号航空母舰正面临严重问题，包括补给困难、士气低落以及因长期部署导致的恶劣状况。一家主流媒体指控战争部长皮特·海格塞什隐瞒了关于关键补给基地受损程度的关键信息。该基地为巴林海军支援活动基地，据称在“史诗怒火行动”期间遭伊朗弹道导弹袭击。这些袭击据称严重破坏了五角大楼在整个中东地区的补给与后勤能力。尽管卫星图像显示巴林基地遭受广泛破坏，但五角大楼在很大程度上淡化了其影响。军方表示无人伤亡，运作未受显著影响，但大多数人员已撤离。作为美国在中东唯一的海军基地，巴林基地遭受的广泛破坏，连同其他区域袭击，正促使重新评估美国的存在。作为关键后勤枢纽的巴林基地被毁，严重影响了林肯号维持标准补给和条件的能力。专家建议，伊朗针对后勤设施发动袭击，是旨在削弱美国海军行动的战略举措。美国政府和五角大楼继续否认或淡化这些报道问题的严重程度。